Źródła danych i zasada działania

1. Cel

Naszym celem jest stworzenie aplikacji na telefon/webową która pozwoliłaby określić prawdopodobieństwo zarażenia chorobami przenoszonymi drogą płciową dla różnych patogenów. Użytkownik naszego programu, będzie miał możliwość bezpłatnie i w dowolnym czasie oszacować szansę zakażenia w odniesieniu do pojedynczego aktu płciowego na podstawie znanych, bądź domniemanych atrybutów partnera.

2. Materiały i model

Użytkownik ma za zadanie wypełnić krótką ankietę online, bądź offline na uprzednio zainstalowanej na telefonie aplikacji, a w wyniku utrzyma numeryczne prawdopodobieństwo oszacowane na podstawie naszego algorytmu. Model matematyczny, który za tym stoi to iloczyn warunkowej chorobowości z warunkowym prawdopodobieństwem zarażenia. Pytania są dobrane właśnie pod kątem znanych liczbowych z literatury czynników ryzyka. Póki co część efektów wprowadzono ręcznie, wiec model daje poprawny wynik tylko w rozumieniu rzędu wielkości, ale zamierzamy każdy czynnik potwierdzić parametrem literaturowym z cytowaniem. Słownictwo jak i treść pytać jest póki co pilotażowa i na studentach zamierzamy zbadać postrzeganie kategorii poznawczych o które pytamy.

Algorytm na podstawie odpowiedzi na temat aktu płciowego (informacja o typie kontaktu- Ia) oraz osoby z którą ten stosunek ma miejsce (informacja o osobie - Io) wyznacza prawdopodobieństwo zdarzenia Z - zakażenia P(Z). Zakładam, że można zapisać to szukane prawdopodobieństwo P(Z)=P(H\Io)*P(F\Is) jako iloczyn prawdopodobieństw warunkowych: szansy na kontakt z zarażonym (H – zdarzenie, że wybrana osoba jest zarażona) i prawdopodobieństwa zakażenia w kontakcie z zarażonym (F – zdarzenie, zakazimy się od osoby zarażonej).

3. Realizacja i komentarze

Testowa wersja aplikacji dostępna jest pod adresem: http://gulakov.cba.pl/ankieta.php. Nie posiada jednak ona pełnej funkcjonalności oraz ograniczona jest jedynie do szacowania ryzyka dla wirusa HIV. Nasz projekt plasuje się w nowoczesnej tematyce e-health („e-zdrowie”) oraz m-health („zdrowie w telefonie”). W literaturze ani w praktyce epidemiologicznej nie znaleźliśmy żadnego narzędzia informatycznego pozwalającego na liczbowe szacowanie ryzyka zakażenia, a jedynie jakościowe określenie grupy ryzyka. W związku z bardzo delikatną tematyką dotyczącą seksualności, zdajemy sobie sprawę z potencjalnych trudności, aczkolwiek waga problemu jest na tyle poważna, że pomimo wielu kontrowersji warto zajmować się tym problemem.

4. Źródła danych parametrów – Prawdopodobieństwo zakażenia w kontakcie z zarażonym

Tabela 1 Ryzyko 1/10000 aktów seksualnych oraz skalowane Risk Ratio (Ryzyko względne)

Działanie	Surowe ryzyko [1]	Użycie prezerwatywy zredukowane ryzyko [2]	Inne STD u siebie jako (risk ratio) [3]	Inne STD u partnera (risk ratio [4]
Analny odbiorczy	138	72	2.65	2.58
Analny inwazyjny	11	63	2.65	2.58
Waginalny inwazyjny	8	80	2.65	2.58
Waginalny odbiorczy	4	80	2.65	2.58

[1]Patel, P., Borkowf, C. B., Brooks, J. T., Lasry, A., Lansky, A., & Mermin, J. (2014). Estimating per-act HIV transmission risk: a systematic review. AIDS, 28(10), 1509-1519. doi: 10.1097/QAD.0000000000000298

[2] Smith, D. K., Herbst, J. H., Zhang, X., & Rose, C. E. (2015). Condom effectiveness for HIV prevention by consistency of use among men who have sex with men in the United States. J Acquir Immune Defic Syndr, 68(3), 337-344. doi: 10.1097/QAI.0000000000000461

[3] Hughes, J. P., Baeten, J. M., Lingappa, J. R., Magaret, A. S., Wald, A., de Bruyn, G., . . . Partners in Prevention, H. S. V. H. I. V. T. S. T. (2012). Determinants of per-coital-act HIV-1 infectivity among African HIV-1-serodiscordant couples. J Infect Dis, 205(3), 358-365. doi: 10.1093/infdis/jir747

[4] Gray, R. H., Wawer, M. J., Brookmeyer, R., Sewankambo, N. K., Serwadda, D., Wabwire-Mangen, F., . . . Rakai Project, T. (2001). Probability of HIV-1 transmission per coital act in monogamous, heterosexual, HIV-1-discordant couples in Rakai, Uganda. Lancet, 357(9263), 1149-1153. doi: 10.1016/S0140-6736(00)04331-2

5. Źródła danych parametrów – Chorobowość (występowalność) – szansa na kontakt z zarażonym

Rys. Przykładowa struktura wiekowa z odsetkiem zarażonych [5]

Risk Ratio dla kategorii: Liczba partnerów (hetero) [5]:Poniżej przeciętnej 16/20?, Średnio 1, Powyżej przeciętnej 20/16

[5] Shisana, Olive. South African national HIV prevalence, HIV incidence, behaviour and communication survey, 2005. HSRC press, 2005.

Chorobowość u wybranych kategorii: IDU ~ 14.0% [6] , MSM USA ~8.3% [6], Bogate kraje 6-12% [8], Transgender ~14% [7]

[6] Holmberg, Scott D. "The estimated prevalence and incidence of HIV in 96 large US metropolitan areas." American Journal of Public Health 86.5 (1996): 642-654.

[7] Valleroy, Linda A., et al. "HIV prevalence and associated risks in young men who have sex with men." Jama 284.2 (2000): 198-204.

[8] Sullivan, Patrick S., et al. "Reemergence of the HIV epidemic among men who have sex with men in North America, Western Europe, and Australia, 1996–2005." Annals of epidemiology 19.6 (2009): 423-431.

Risk Ratio dla kategorii Liczba partnerów (MSM [9): Poniżej przeciętnej – ½; Srednio 1; Powyżej przeciętnej 2

Risk Ratio: [9] Narkotyki twarde x2

[9] Marks, Gary, Nicole Crepaz, and Robert S. Janssen. "Estimating sexual transmission of HIV from persons aware and unaware that they are infected with the virus in the USA." Aids 20.10 (2006): 1447-1450.

Chorobowość średnia (18-49) za WHO (CIA factsheets)

Polska – 0,1%

Były ZSSR – 1,1-0,4%

Bogate rozwinięte – 0.2-0.8%

Czarny/biały (Bogate rozwinięte) USA 10:1 CDC: HIV Surveillance Reports (w innych badaniach 5:1)

Afryka 2-20%

Liga Arabska 0,1-0,3%

ASOAN 0,1-1.2%

Daleka Azja 0,2%

Ameryka Środkowa 0,9-1,8%

Ameryka Płd 0,3-0,6%